Да, нужно выделить эти слова запятыми.
Верен второй вариант.
Корректно: Я всегда отвечу да.
Да, нужно: Всё было, как всегда, прекрасно.
В пунктуации следует избегать слова "всегда". Обычно обособляются вводные слова, некоторые определительные и обстоятельственные обороты, сравнительные обороты и некоторые другие сочетания.