Предлог за лишний. Корректно: Инструкцию №...
Лучше так: выдать новый исполнительный лист взамен выданного ранее.
Оба варианта возможны. Инициалы имени и отчества нужно поставить перед фамилией: Выдать Л. В. Ивановой...
Вынуть – единственное в русском языке слово без корня. Когда-то в этом слове корень был, но утратился вследствие исторических преобразований.
Вытащить - разговорный вариант, вынуть - общеупотребительный.
Корректно раздельное написание.