Правилен первый вариант.
Воспользуйтесь нашими электронными словарями в окне «Искать на Грамоте» (не забудьте поставить галочку против толково-словообразовательного).
Слово високосный происходит от искаженного латинского bissextus – «дважды шестой», т. е. год с двумя шестыми числами перед мартовскими календами в летоисчислении древних римлян. Со словом высоко прилагательное високосный никак не связано, букве ы в нем неоткуда было взяться.