Предлог за лишний. Корректно: Инструкцию №...
Лучше так: выдать новый исполнительный лист взамен выданного ранее.
Оба варианта возможны. Инициалы имени и отчества нужно поставить перед фамилией: Выдать Л. В. Ивановой...
Правильно: взимать.
Да, запятую надо поставить.
Корректно раздельное написание.
Эти фамилии склоняются.