Правильно: пробурённая.

Правильно раздельное написание: скважина, не прошедшая регистрацию. Не пишется раздельно с причастиями, если есть пояснительные слова.

При составных числительных, оканчивающихся на один, сказуемое, как правило, ставится в форме единственного числа. Поэтому верно: Была остановлена 21 скважина.

Последний вариант оптимален.

Правильно: отстоит на расстояние 500 метров. Или лучше: отстоит на 500 метров.

Если вторая часть бессоюзного предложения поясняет то, о чем говорится в первой части (в таких случаях возможна подстановка слов а именно), между частями ставится двоеточие. Таким образом, перед это следует поставить двоеточие.

В остальном пунктуация верна.

Закаченный – от закатить, закачанный – от закачать. Правильно в данном контексте: закачано. 

Правильное написание: геолого-разведочный, наклонно направленный.