Эти прилагательные пишутся слитно, т. к. образованы от пишущихся слитно существительных пусконаладка и шефмонтаж.
Корень живот-, суффикс -н- и окончание -ое.
Запятая перед и нужна, так как слова управляющего розничной сетью ОП Екатеринбург - это приложение, которое выделяется запятыми с двух сторон.
Корректно: В ответ на письмо В.М. Борисова и принимая во внимание письмо Ю.В. Александрова направляю Вам для подписания договор, скорректированный с учетом замечаний ранее перечисленных лиц.
Запятая после деепричастного оборота не ставится, так как деепричастный оборот выступает в качестве однородного члена предложения с необособленным обстоятельством.