См. ответ на вопрос № 231718.
Ответ на Ваш вопрос есть в «Письмовнике».
Корректно: убивает бактерии и убивает бактерий.
См. также: http://gramota.ru/spravka/letters/?rub=odush
Сочетание стилистически небезупречно, его следует перестроить, например: посмотреть видео о бактериях и вирусах.