Нормы правописания фиксируют орфографические словари.
Орфографический словарь
Аффилировать - присоединять предприятие, фирму к другому, более крупному предприятию в качестве филиала.
Верно: аффилированный. См. словарную статью из «Большого толкового словаря русского языка» под ред. С. А. Кузнецова.