Здесь верно: начальник с подчиненными ушли вовремя. Ср.: начальник ушел с подчиненными.
Лучше: Ремонтные работы по адресу ул. Иванова, д. 1, корп. 2, выполнены.
Корректно: о Уильяме, о Уитни.
Мужскую фамилию нужно склонять (с выпадением или без выпадения гласной - по желанию).
Оснований для постановки тире нет.
В данном случае Индийский - часть собственного наименования.
Инфинитив зимовать является обстоятельством цели.
Правильно: со вкусом лимона. Это сочетание может входить в название, а может не входить.
Расхождения в орфографических рекомендациях могут быть связаны с разными причинами, например со временем подготовки словарей к изданию.
Смысловой разницы между вариантами кулинария и кулинария нет. См., например, фиксацию в «Большом толковом словаре» под ред. С. А. Кузнецова. Ударение на а обусловлено происхождением слова: в латинском culinarius 'кухонный' акцентировался именно третий слог. Однако в русском языке ударение в этом слове давно имело тенденцию к смещению на и. Еще в «Толковом словаре русского языка» под ред. Д. Н. Ушакова (М., 1935–1940) были отмечены оба произносительных варианта. В дальнейшем некоторые словари характеризовали вариант кулинария как разговорный или допустимый, но в радио- и телеэфире словарем «Русское словесное ударение» М. В. Зарвы (М., 2001) было предложено говорить именно кулинария.