Нет, больше никаких знаков ставить не нужно.
Запятую нужно поставить между частями сложного предложения: Всё проверили, и вот что удалось выяснить: <...>.
Колодезный - производное от колодезь, поэтому слова колодец и колодезный нельзя считать однокоренными.
Перед союзом когда ставится запятая, так как он начинает придаточное предложение.
Поскольку здесь представлен фрагмент речи, принадлежащей одному лицу, то необходимости в использовании тире нет (тире при оформлении прямой речи используется для маркирования смены говорящих или для отделения прямой речи от слов автора): Хотелось бы мне чего-то большего? Да. Считаю, что Петя этого хочет? Нет.
В этом восклицательном предложении содержится частица не: Да с кем они только не танцевали!
Пожалуйста, пришлите нам предложение, в котором Вы затруднились со знаками препинания, целиком.
Слова да и нет, выражающие утверждение и отрицание, в составе предложения отделяются или выделяются запятой. Верно: Нет, я.
Таких слов нет (разве что аббревиатуры).
Лучше: численность уменьшается.
