Правильно: из города Москвы. См. «горячий вопрос» номер три.
Верно: Я из города Москвы.
Лучше: агентство Казани.
Правильно: города Люберцы. Географические названия в сочетании с родовым словом не склоняются, если внешняя форма названия соответствует форме множественного числа.
Корректно: мэр Москвы, мэр города Москвы.
См. в словарях.
Корректно: ...учреждению Великого Новгорода. В канцелярской речи: ...города Великого Новгорода.
В образцовой литературной речи названия городов склоняются в сочетании со словом город: лицей города Лобни. Но в официальных документах название должно указываться в соответствии с тем, как оно зарегистрировано.
Ваш вариант оформления фрагмента представляется уместным.
Спасибо, Игорь, и Вам счастливого Нового года! Указанная запятая нужна.