Верен первый вариант.
Запятая перед союзным словом как нужна, так как в каждом случае оно вводит придаточное изъяснительное предложение: 1) понимание, как строятся новые модели; 2) знания, как создать новую последовательность.
Трудно судить о правильности по отдельным фрагментам. Нужно видеть более обширный контекст.
Верно: грушевое дерево и груша.
Доказать можно, сославшись на словари, где зафиксировано именно такое значение этого сочетания.
Запятая не нужна: союз и соединяет однородные придаточные части, зависимые от одной главной.
Рематический - прилаг. от слова рема.
Словарь методических терминов
РЕМА. При актуальном членении предложения коммуникативный центр высказывания, содержание сообщения (новая информация); то новое, что говорящий сообщает, отправляясь от темы (см. тема во 2-м знач.).
Корректно: Наша школа небольшая. Не новая. И не суперсовременная.
См. ответ на вопрос № 257956.
Оба варианта правильны.
