Строгая литературная норма требует склонять русские и хорошо освоенные иноязычные названия городов в сочетании со словом город: в городе Байконуре. Отсутствие согласования (в городе Байконур) можно встретить в официально-деловом стиле, в административно-судебной речи.
Об организации (структуре): управление чего. О деятельности: управление чем.
Верно: участвовать в торгах.
Правильно: пуэрто-риканский гражданин, но: пуэрториканец.
Оба варианта возможны. См. ответ на вопрос № 276520.
Правильно: в созданном им институте (предложный падеж). Но: созданным им институтом (творительный падеж).
Правильно: многофакторный.
Правильно: навевает мысли (но: наводит на мысли).
Верен первый вариант.
Предложение стилистически небезупречно, рекомендуем его перестроить. Но с формальной точки зрения слово насыщены следует писать с одной Н.