Выбор буквы зависит от того, как функционируют эти организации, насколько можно о них говорить как о самостоятельных организациях или как о частях организаций. Дело в том, что названия частей и отделов учреждений, организаций, а также слова типа президиум, ученый совет, совет директоров, правление и др. пишутся строчными (совет директоров ОАО «РЖД»). Если организации, о названиях которых Вы спрашиваете, обладают всё же самостоятельностью, пусть и находясь в структуре СО РАН, СПР России (т. е. они ближе к официальным названиям общественных организаций, чем к названиям частей учреждений), то корректно написание с прописной: Совет молодых ученых СО РАН, Совет молодых литераторов Союза писателей России.
Пунктуация верна.
В зависимости от смысла возможна двоякая пунктуация: с запятой и без запятой. Запятая ставится, если определение имеет некоторое добавочное значение 'не просто практики, а именно хорошей и разной'.
Здесь верно: ...организации.
Правильно: организация информационного обеспечения мероприятия, информирование о ходе реализации мероприятия.
Правильно: в "Технопорте", в организации "Технопорт".
Если вопрос в том, как пишется слово 10-летний, то Вы написали верно, дефис нужен.
В данном случае правильным будет вариант: «организация передала в собственность городскому округу город Тобольск».