Фламенко – несклоняемое существительное среднего рода.
Название города Салоники – существительное pluralia tantum (т. е. имеющее формы только множественного числа). Во множественном числе род не определяется.
Визави – существительное мужского и женского рода, поэтому возможны разные окончания у прилагательного.
Если аббревиатура распространенная, то можно выяснить род при помощи словаря. В противном случае род аббревиатуры обычно соответствует роду центрального по смыслу слова в расшифровке (и в переводе) аббревиатуры.
Предпочтителен второй вариант.
Оба варианта возможны: отнесен и отнесены. См. в «Письмовнике»: Единственное и множественное число сказуемого.
Указанная Вами в скобках запятая не нужна.
Предпочтительный вариант: в ходе проверки выявлен ряд недочетов.