Если есть техническая возможность, то можно писать в верхнем индексе. Так может быть оформлен логотип. Хотя, полагаем, вряд ли такое написание можно встретить в учредительных документах компании.
Нужно смотреть по контексту, но чаще пишется без запятой: Директор Иванов Иван Иванович.
Дополнительные знаки препинания не требуются.
Верно: Вы молодец, Иван Иванович.
Оба варианта возможны, а выбор одного из них зависит от контекста и традиций оформления, принятых, в частности, в организации. Вариант Награждается Иван Иванов предпочтителен, поскольку адресован конкретному лицу. Официальный вариант Иванов Иван используется в документах и прочих деловых бумагах, поскольку в них именно фамилия человека есть самое важное звено в его имени.
Словарь имён собственных
Запятая не нужна.