Если вопрос связан с обособлением слов на первый взгляд, то отвечаем, что в приведенном контексте эти слова обособляются.
Такового устойчивого выражения в русском литературном языке не существует. Ср.: нервы расстроились, разыгрались, расходились и т. п.; успокоить, испортить, расшатать, трепать и т. п. чьи-л. нервы; действовать на нервы, играть на нервах.
Здесь возможны оба варианта (см., например, «Справочник по русскому языку: правописание, произношение, литературное редактирование» Д. Э. Розенталя, Е. В. Джанджаковой, Н. П. Кабановой, раздел «Два определения при одном существительном»).
Это равноправные варианты. Выбирает автор текста.
Правильно: командующий (чем?) корпусом, армией, флотом.
Оба варианта корректны.