Постановка кавычек не требуется, но лучше написать агент Икс (во избежание прочтения читателем как "агент Ха").
Склонение (точнее, управление падежом названия Домодедово) корректно.
Запятая после но лишняя, ее нужно убрать.
Запятая не нужна, поскольку между однородными придаточными предложениями есть союз и.
В «Википедии» явная ошибка. Все доступные нам словари и справочники (как словари русского языка, так и специализированные издания, в том числе «Биологический энциклопедический словарь» 1989 года) дают единственный вариант ударения: гладиолус.
Пунктуация корректна.
Оба варианта верны. Слово микроб может употребляться и как одушевленное, и как неодушевленное существительное.
Знаки препинания расставлены верно.
Правильно в родительном падеже мн. числа: сидений.
Правильно раздельное написание: двадцать первое сентября. Скорее всего, Вы неправильно поняли учительницу (возможно, она говорила о словах типа двадцатипятитысячный?).