Требуется более широкий контекст. Возможно, Вам пригодится информация из «Словаря трудностей».
Судя по всему – вводное сочетание. Вводные слова и сочетания обычно не отделяются знаком препинания от присоединительного союза, стоящего в начале предложения: Но судя по всему, на этом власти намерены поставить точку. Но запятая может быть поставлена, если вводное сочетание судя по всему выделяется интонационно. Окончательное решение принимает автор текста.
Нет. Верно: по вопросу, касающемуся...
Слова по возможности не требуют обособления.
В значении "после прибытия" - по прибытии.
См. ответ № 210104. Проверять написание следует по орфографическим, а не толковым словарям. Пользуйтесь электронной версией «Русского орфографического словаря» в окне «Искать на Грамоте».
Даже если окончание срока давности является причиной того, что дело закрыто, при таком строе предложения возможен лишь один вариант: по истечении срока давности.