Вы задаете непростой вопрос. Действительно, со слова например начинается пояснительный оборот. Вводные слова, стоящие в начале обособленного оборота, от самого оборота запятой не отделяются, чтобы читателю было понятно, что вводное слово относится именно к обороту, а не к предшествующему тексту. Но в Вашем примере сам оборот графически оформлен как самостоятельное предложение (такое явление называется парцелляцией). Подобные ситуации в справочниках по пунктуации не описаны. При этом указано, что, выделяя оборот скобками (т. е. более сильным знаком), запятую после вводного слова ставить нужно (например, как здесь). Полагаем, что после точки, как и после скобки, обособление вводного слова предпочтительно. 

В данном случае предпочтительно без запятых.

Спасибо! Поправили.

В данном случае корректно использование тире: (Филиал КУП «Ромашка» — «Ромашка № 1»), так как это предложение с пояснительной конструкцией. 

Да, перед желательно нужно поставить знак препинания — запятую или тире. Конструкцию желательно с камерой наиболее корректно будет интерпретировать как неполное предложение, сравним: Желательно созвониться с камерой.

Организация «Мостотрест», в чьем ведении находятся мосты Санкт-Петербурга, в том числе 18 разводных, ежегодно публикует график разводки мостов. В историческом очерке о службе мостового хозяйства (см. сайт «Мостотреста») встречаются слова разводка и наводка. В публицистических и литературных текстах описано множество самых разных случаев, так или иначе связанных с разводом мостов. Вывод: допустимость названных слов не подлежит никакому сомнению.

Это четверостишие может оказаться полезным для иллюстрации различий в употреблении сочетаний что бы ни и чтобы не. 

Да, запятая лишняя. Слово ну использовано здесь в роли усилительной частицы, но никак не междометия.

Правильно: суперъяхта, в соответствии именно с тем правилом, которое Вы назвали.

Запятая после сочинительного союза и нужна, поскольку подчинительный союз когда не имеет второй части. Обратите внимание, что сочетание топ-три (топ-3) пишется через дефис.