Верно слитное написание.
После воссоединения Восточной и Западной Германии директор Европейского департамента в 1995 г. в специальном документе (со ссылкой на договоренность министерств иностранных дел России и Германии) подчеркнул решение сторон не склонять по падежам слово Германия в официальном названии государства – Федеративная Республика Германия.
Дополнительные знаки препинания в Вашем предложении не нужны.
См. «Словарь трудностей».
Верно: необъяснимых (чем?) логикой.
Возможно. Слово "идти" пишется по морфологическому принципу: корень "ид" и суффикс "ти" соединяются в одно слово. Слово "прийти" - по фонетическому принципу: написание приближено к произношению.
В таком случае лучше написать: причина не является уважительной.
Верно: неотделимый без вреда.