Верен второй вариант, поэтому знак нужен. Это может быть либо запятая, либо тире – знак, подчёркивающий значение результата, следствия.
Чимкент – русское название города, Шымкент – казахское. Если приводить казахское название, то с буквой Ы: в иноязычных именах собственных написание Ы после шипящих возможно.
Корректно: в устье реки Колымы.
Можно повторить предлог, можно не повторять. Ошибки здесь в любом случае не будет.
Нет, после вами никакой знак не нужен.
Нет, верно написание без пробела.
Как насчет третьего варианта? Отчуждению подлежит 619 голов.
Если слово вовремя относится к обоим определениям, то оба они пишутся раздельно: не заполненный и не сданный. Если только ко второму, то корректно: незаполненный и не сданный вовремя...
Употребительно: психофизиологическое исследование на полиграфе.
Постановка тире корректна.