Предпочтительна форма мужского рода.
Знаки препинания расставлены верно.
Таким образом правильно: Хаиндравы, Хаиндраву и т. д.
Фамилии с конечным о несклоняемы; таковы фамилии Гюго, Клемансо, Ларошфуко, Мийо, Пикассо, Марло, Шамиссо, Карузо, Леонкавалло, Лонгфелло, Ремесло, Доливо, Дурново, Хитрово, Бураго, Мертваго. По строгим нормам литературного языка это распространяется и на фамилии украинского происхождения с конечным -ко (среди которых много на -енко): Короленко, Макаренко, Франко, Квитко, Шепитько, Бондарсо, Семашко, Горбатко, Громыко.
Таким образом, правильно: Виктора Ющенко, Виктору Ющенко.
Так можно писать и говорить. Сочетание чистая душа зафиксировано в словарях русского языка, оборот с чистой душой употребляли М. А. Булгаков, Ф. В. Гладков, Л. М. Леонов, В. Г. Распутин, Б. Л. Васильев и другие писатели. Например: Тяжелая, недобрая ночь ― в такую ночь маются и с чистой душой, а у нее, у Настены, истерзанная, беспутная душа надорвалась и только ноет, ноет, жалуясь и плача без капли надежды. В. Распутин, Живи и помни. Они за работу-то с молитвой принимались, с чистой душой. Ф. Гладков, Повесть о детстве.
Пунктуация верна. Запятая перед обязан нужна.
Пунктуация зависит от значения (и роли в предложении) слов кроме этого.
Это могут быть вводные слова, и тогда запятые нужны. Это может быть оборот со значением "дополнительно, вдобавок к чему-либо". Такие обороты чаще выделяются запятыми, но могут и не выделяться. Подробнее об этом см. в "Справочнике по пунктуации".
Дело в том, что существительные, использованные в данных сочетаниях, в форме множественного числа практически не употребляются.
Правильно: глава столичного стройкомплекса.