Правильно: на двухстах пятидесяти листах.
Это так называемое эллиптическое предложение (самостоятельно употребляемое предложение с отсутствующим сказуемым). В таких предложениях при наличии паузы ставится тире, при отсутствии паузы знак не нужен.
Оба варианта соответствуют норме.
Верно: Приложение: на 5 л.
Если речь идет в том числе и о правилах выезда на переправу, то корректен.
Запятые не нужны.
Слово однако не выделяется знаками препинания в роли союза – в начале предложения при смысловом соединении с предшествующим предложением или в начале предикативной части сложносочиненного предложения. В этом и состоит правило.
Знаки препинания в предложении расставлены правильно.
Кавычки уместны. На наш взгляд, само выражение "на полях" здесь употреблено неудачно.
Корректно: ...на базе Федерального государственного бюджетного учреждения науки «Институт математики...» или на базе Института математики...