Да, впрочем отделяется запятой: Впрочем, он и сам это знал.
Запятая перед в 40 км нужна.
Здесь лишнее слово "сам".
Рекомендуем перестроить предложение: Я гладил пса по голове, не зная, успокаиваю его или успокаиваюсь сам.
Пробел между инициалами необходим в любом контексте.
В этом случае уместно говорить о транслитерации, поскольку пока упомянутые слова вряд ли можно отнести к заимствованным. Представленные Вами варианты написания корректны.
Верно: В связи с недобросовестным выполнением своих должностных обязанностей, приведшим к аварийной ситуации...
Запятая перед союзом раз нужна.
Словарная рекомендация такова:
орден 1, -а, мн. -а, -ов (знак отличия)
орден 2, -а, мн. -ы, -ов и -а, -ов (организация; архит.)
Корректно: резервный масштабируемый модуль. Во втором варианте, скорее всего, опечатка.