Верно: по вопросам, связанным с...
Да, сочетания по данным (кого-либо, чего-либо, чьим-либо), по сведениям (кого-либо, чего-либо, чьим-либо) являются вводными и обособляются. Подробнее см. в «Справочнике по пункутации».
Верно: цех по переработке и складированию.
Правильно: по окончании (в значении "после чего-либо").
Корректура – это исправления, связанные с правилами правописания, опечатками, версткой и т. п., которые вносятся перед публикацией. Если исправления касаются содержания, то верно: корректировка технического задания.
Слова по крайней мере в данном случае не обособляются: Дело в том, что по крайней мере для некоторых из нас... Подробнее см. в "Справочнике по пунктуации".
Существуют обе формы слова доплата - единственного и множественного числа.
Да, слова по заверению продавца корректно обособить как вводные, указывающие на источник сообщения.
Фразеологизмы с союзом как не обособляются, поэтому запятая перед как не нужна.
Оба варианта возможны.
