В названиях организаций с большой буквы пишется первое слово и входящие в состав названия имена собственные. Если это официальное название музея, то корректно писать слово музей с большой буквы: Музей Московского вертолетного завода им. Миля.
Верно писать с ни.
Запятые не нужны: определительный оборот стоит перед определяемым словом.
К сожалению, назвать "лучший" трудно. Есть разные критерии: объем словника, актуальность и полнота рекомендаций, авторитетность издания и др.
Оба варианта возможны. См. подробнее в «Письмовнике».
Оба предлога возможны.
Если вторая часть бессоюзного сложного предложения представляет собой вопрос, необходимо двоеточие: Сейчас каждый спрашивает: какова будет его судьба и судьба России? Если оформить предложение как сложноподчинённое (с точкой), нужна запятая: Сейчас каждый спрашивает, какова будет его судьба и судьба России.
Постановка запятой возможна (при интонационно-логическом выделении). Верно: все так же.
Перед союзом и нужна запятая.
Запятая не ставится.