Запятые не требуются.
Оба варианта не отвечают литературной норме. Можно использовать субстантиват - согласующие.
Запятая перед кроме нужна.
Аббревиатура Минкомсвязь (Министерство связи и массовых коммуникаций Российской Федерации) женского рода и склоняется как слово связь: в Минкомсвязи, с Минкомсвязью.
Фразу нужно перестроить. Возможен такой вариант: Они проверили 51 учреждение, где проживали нелегалы.
Правильны все приведенные Вами варианты переноса. Правило звучит так: группа неодинаковых согласных букв в середине слова, входящих в корень или образующих стык корня и суффикса, может быть разбита переносом любым образом.
Выбор варианта зависит от контекста.
Возможно: Кофе - он и в Китае кофе.
Пишется слитно. Но лучше написать предварительная регистрация.
К сожалению, словарной рекомендации нет. Предпочтительное написание (в зависимости от произношения): снепшот или снапшот.