Названия, написанные латиницей, в русскоязычных текстах в кавычки обычно не заключаются.
Да, такой вариант оформления корректен.
Предпочтительно не обособлять запятыми.
Второй дефис нужен.
Думаем, что нет.
Слова федеральное государственное учреждение пишутся строчными буквами.
Название книги следует заключить в кавычки.
Нет, некорректна. Действие, обозначенное деепричастием (размышляя), должно совершаться тем же лицом, которое является подлежащим в главной части предложения. В предложении "в тексте отмечается" подлежащее отсутствует. Возможный вариант исправления: Размышляя об этой проблеме, автор текста отмечает...
Если так передается официальное название министерства, то правильно написание с прописной буквы; если нет, то нужно писать со строчной.
Оба варианта возможны.