Запятая не нужна.
Если трест является филиалом АО «РЖДстрой», то грамматически корректно: управляющий строительно-монтажным трестом № 11 – филиалом АО «РЖДстрой». Но нужно учитывать, что в официальном названии должности должно быть точно воспроизведено официальное название организации.
Да, правильно.
Запятая нужна, это сложносочиненное предложение.
Можем предположить: и у слова, и у дерева есть корень.
Запятая поставлена правильно.
Запятая не нужна: оборот с как образует именную часть сказуемого.
Основной вариант: К ним пришел молодой врач. Если автору важно подчеркнуть, что это женщина, и по контексту других способов нет (например, нет имени собственного), то возможно: К ним пришла молодая врач. Правила см. в "Письмовнике".
Если это вопросительное предложение, то да, конечно, ставится.
