Если значение «так же, как и на первом этапе», запятая нужна.
Тире здесь возможно (как интонационный знак), но не обязательно.
Предложение корректно, запятые расставлены правильно.
Вот возможные варианты: два с половиной года, два года шесть месяцев, 2,5 года.
Кофе – существительное мужского рода (в образцовой литературной речи) и среднего (в разговорном употреблении).
Корректно согласование в ж. р.
Словарной рекомендации по поводу родовой принадлежности этого слова пока что нет. Можно использовать судоку как существительное женского рода (по родовому слову - игра или головоломка) или как слово среднего рода (так как несклоняемые имена существительные иноязычного происхождения, обозначающие неодушевленный предмет, в своем большинстве относятся к среднему роду).