Нет, никакие другие знаки препинания, кроме точки в конце, в этом предложении не нужны. Можно (но вовсе не обязательно) поставить интонационное тире после уже.
Дополнительные знаки препинания не требуются.
Указанная запятая нужна.
В грамотах нужно ставить запятые, постановка которых требуется по условиям контекста.
После слов тем не менее запятая не нужна. Если слова тем не менее начинают собой придаточную часть сложного предложения или противопоставляют однородные члены предложения, то перед этими словами ставится запятая.
В приведённом Вами примере запятая нужна. О пунктуации при словах такой как см. в «Справочнике по пунктуации».
Грамматическая структура приложения, построенного при помощи выражения "по имени", при изменении главного слова не изменяется: Енотик по имени Ров, Енотику по имени Ров и т. п.
