Запятые нужны: Один из них, Андрей Ковальчук, работает здесь, в Кижах.
Названия отделов организаций пишутся строчными буквами.
В любом случае ответа да или нет на такой вопрос недостаточно. Правильнее будет повторить глагол и ответить: Нет, не работает. Можно ответить проще: Не работает.
Да, склонение корректно. Географические названия, имеющие форму полного прилагательного, обычно согласуются с родовым словом.
Пунктуация верна. Правильно: по-настоящему.
Запятая не нужна. Обстоятельственные обороты «с точки зрения (чего-либо, какой-либо)» не обособляются, в отличие от сочетаний «с точки зрения (кого-либо, чьей-либо)», которые выделяются как вводные.
Можно использовать оба слова: и число, и количество.
Выражение корректно. Ср.: никто не пришел, ничто не забыто.
Если работу будут продолжать по той же причине, что и "работают в тесной кооперации с университетами", запятая перед и не требуется.
Можно использовать и единственное, и множественное число. Выбирать Вам.
