Вы правы: разные (хотя и родственные) корни, разное написание.
Это другие корни, правописание которых не регулируется правилом о ТВАР-ТВОР.
Все просто. Чтобы разобраться в вопросе, выделите корни этих слов.
Согласно морфемному словарю, у этих слов разные корни: вер- и верн-.
Здесь используются греческие, а не латинские корни: монолог, диалог; дилогия, трилогия, тетралогия.
Слова с чередующимися гласными в корне не проверяют ударением. См.: Корни с чередующимися гласными.
Эти слова исторически родственны, но сейчас в них выделяются разные корни: нож/ и ножниц/ы.
Кавычки не нужны, между словами ставится тире: отношения типа начальник — подчиненный, рядовой — офицер, крепостной — барин.