С точки зрения системы современного русского языка в этом слове один корень.
Сочетание как родной обособляется потому, что это сравнительный оборот.
Правильно: говорить на каком-либо языке, например: говорить на русском языке, говорить на родном языке; с наречием: говорить по-русски.
Вариант с творительным падежом возможен только в устойчивом обороте русским языком говорить 'говорить ясно, понятно', например: Вам говорят русским языком, имение ваше продается, а вы точно не понимаете (А. Чехов, Вишневый сад).
Правилен первый вариант.
Предпочтительно: между первым и пятым днем процесса наступает переломный момент. (Но: Первый и пятый дни процесса прошли спокойно.)
Можно так: Первой книге, букварю, я спасибо говорю (если букварь и есть первая книга).
Все слова пишутся с маленькой буквы: аккредитационный сертификат первой категории.