Правильно: к договору, заключенному...
Если внутри слов, заключенных в кавычки, встречаются другие слова, в свою очередь заключенные в кавычки, рекомендуется (при условии, что для этого есть технические возможности) использовать кавычки разного рисунка: внешние – «елочки», внутренние – „лапки“ (или – в текстах, набранных на компьютере, – "компьютерные кавычки") . Если же такой технической возможности нет, то закрывающие кавычки ставятся только один раз. Кавычки одного рисунка рядом не повторяются.
Предпочтительно: «Методическое руководство ОАО "Газпром"», допустимо: "Методическое руководство ОАО "Газпром".
Если нет зависимых слов - "не выполнило своих обязательств". При наличии таковых - "не выполнило свои обязательства в части..."
Правильно: ООО (общество с ограниченной ответственностью) рассмотрело и согласовало.
Правильно: в результате проверки ОАО «Грузовая компания».