Запятая в предложении может ставиться как перед составным союзом (перед словом НЕСМОТРЯ), так и между частями союза (перед словом ЧТО). Главное: запятая ставится только один раз; ставить запятую и перед союзом, и между его частями не нужно.
В этом контексте употребляется частица не: чего только в ней не было...
Правильно: Кто это, как не она?
Правильно: Кто бы что ни говорил.
Если а то -- это союз (значения союза а то см. в окне «Искать на Грамоте»), запятая не требуется.
Корректно: То, что дала природа, сложно изменить.
Запятая не ставится.
Соответствует правилам такая пунктуация: То, что не стереть, как сильно ни три, — свобода — это то, что у меня внутри! Однако предложение воспринимается плохо, поэтому лучше его перестроить.
См. в "Справочнике по пунктуации".
