Верно раздельное написание.
Это слово среднего рода. Род аббревиатуры определяется по опорному слову (министерство).
Запятая после у него нужна.
Дополнительные знаки препинания в Вашем предложении не нужны.
См. «Словарь трудностей».
В данном случае необходимо раздельное написание.
Да, вводное слово возможно обособляется.
Запятая перед тире нужна: придаточное предложение по которой за это берётся именно государство выделяется запятыми с обеих сторон.