Пунктуация зависит от смысла. Если слова по сути употребляются в значении по сути говоря, то они являются вводными, запятая нужна: По сути, это капитуляция. Но они могут являться и членом предложения, например: По форме это победа, а по сути это капитуляция. В таком случае запятая не нужна.
Выражение настроить под себя широко используется, особенно в разговорной речи. Технические контексты — весьма распространенное «поле» применения этого оборота, отличающегося по своему значению от предложенных вариантов. Строго говоря, вопрос заключается не в общей стилистической оценке выражений настроить под себя, подобрать под себя, адаптировать под себя, а в том, уместны они или нет в конкретном высказывании (тексте). Как представляется, обсуждаемому высказыванию не свойственны приметы разговорности, а следовательно, сочетание под себя лучше заменить стилистически нейтральным.
Запятая нужна. Подробнее см. в "Справочнике по пунктуации".
Запятая не ставится.
Запятая нужна.
Оба варианта возможны. Примите во внимание смысловые признаки «маленьких» слов: предлог по отмечает параметр сравнения свойств, предлог в указывает на поле (сферу) проявления свойства человека.
Дефис не нужен. Первая часть сложных слов полу... всегда пишется слитно.
Да, эти сочетания обособляются как вводные.
Наречие по-особому пишется через дефис: отношусь по-особому.
