Предложение построено верно.
Правильно: и старая, и новая линия; стоят и стоит; как на федеральном, так и на региональном уровне.
Сомнительно сочетание "на всех годах". Какой именно смысл нужно выразить?
Образование по аналогии с восьмушка возможно, хотя вряд ли такое слово употребительно. Корректно слитное написание, ср.: тридцатьчетвёрка (танк Т-34), сорокапятка (пушка).
В таком взятом без контекста предложении нет оснований для пропуска запятой перед деепричастным оборотом: Сделать это можно, нажав на кнопку. В контексте противопоставления, если деепричастный оборот составляет смысловой центр высказывания, запятую ставить не нужно, сравним: Сделать это можно нажав на кнопку, а можно — силой мысли.
Кавычки не нужны.
Все три варианта возможны, мы бы выбрали первый.
Плоды были не на деревьях, не между ними и не на дороге.
Вместо тире между частями сложного бессоюзного предложения лучше поставить двоеточие.
