См. ответ на вопрос № 283996.
Фамилия Бакерия склоняется. Правильно: аттестат выдан Бакерии.
Фамилия Рахматиллозода склоняется: выдан Рахматиллозоде.
Верно: Подлежал аттестации 91 человек.
Правильно: аттестат о среднем образовании, аттестат зрелости (устар.).
Союз в случае если в начале предложения не нужно расчленять запятой.
Имена и фамилии, оканчивающиеся на -е, -о, не склоняются. Правильно: аттестат выдан Муйибулло Рахматиллозоде.
Судя по всему (хотя предложение не приведено полностью), в данном случае есть три однородных члена предложения, перед каждым из которых, кроме первого, повторяется союз или. Если это так, то корректно следующее пунктуационное оформление: ...аттестат об основном общем образовании, или аттестат о среднем общем образовании и приложение к нему, или справку об обучении из организации. Сравним пример из параграфа 13.6 справочника по пунктуации Д. Э. Розенталя: Иные хозяева вырастили уже вишни, или сирень, или жасмин (Ф.).
Обособление не требуется.