В книжно-письменных стилях верно: Сам автор назвал книгу виртуальным музеем. Можно использовать форму женского рода, если она является единственным показателем того, что речь идет о женщине, а пишущему важно это подчеркнуть: Сама автор назвала книгу виртуальным музеем.
Запятая не требуется.
Настоящее имя поэта - Виктор Владимирович.
Название "Вектор" следует заключить в кавычки. Запятые расставлены верно.
Да, распространенное приложение после имени собственного следует выделять запятыми: Доктор Дикуль, главный ортопед страны, сказал...
В непринужденной речи уместен вариант доктор сказала. В официальных текстах следует использовать форму мужского рода. Подробнее см. в "Письмовнике".
Кавычки не нужны, однако все слова в таких прозвищах пишутся с большой буквы.