Дело в том, что формы в Домодедове, Митине, Бибиреве, Сколкове отнюдь не новые, а, наоборот, старые, отвечающие строгой литературной норме. Склоняемый вариант изначально был единственно правильным, несклоняемый (в Домодедово, Митино, Бибирево, Сколково) распространился относительно недавно и пришел из речи военных и географов (возник он как раз потому, что очень важно было давать названия в исходной форме, чтобы не было путаницы: Иванов или Иваново). В современном русском языке, действительно, допустимы оба варианта: старый (в Домодедове, в Иванове, в Бирюлеве) и новый (в Домодедово, в Иваново, в Бирюлево); если же топоним употребляется с родовым словом (город, село, район и т. п.), он не склоняется: в городе Иваново, в районе Бирюлево.
Норма литературного языка: делать/сделать укол.
Словарной фиксации нет, однако ударение на втором слоге кажется логичным (на той же гласной, что и в словах директор, дирекция).
Правильно: на Москву-реку.
Постановка запятой не требуется (оборот с союзом "как" тесно связан по смыслу со сказуемым).
Тире не требуется.
В этом слове не нужно выделять окончание. Все слово представляет собой корень и основу.
См. в учебнике Е. И. Литневской.