Действительно, слово "список" в заголовке соответствующего раздела содержательно лишнее, но ошибкой сочетание "список литературы" не является. Например: об этом см. в списке литературы (не в "литературе" же!).
Корректно: несет ответственность за исполнение (=является ответственным за исполнение).
Д. Э. Розенталь пишет: «…при согласовании в лице первому лицу отдается предпочтение перед вторым и третьим, а второму лицу — перед третьим». Согласно этой рекомендации правильно: вы или они сделаете.
Существительные на -ье и на -ие имеют разные окончания в формах предложного падежа: упреки в кривлянье, оригинальничанье, но упреки в кривлянии, оригинальничании. Исключение составляет поэтическая речь, в которой возможны написания в молчаньи, в сраженьи и т. п. См. параграф 71 полного академического справочника «Правила русской орфографии и пунктуации» под ред. В. В. Лопатина.
Верно: в Бабьем Яре.
Правильно: в Бабьем Яре.
Можно написать: приемная мэра (руководителя, начальника...).
Пробел между сокращением и цифрой (или латинской буквой), называющей размер, обязательно нужен.
Запятая перед словом раздел лишняя.
Если в старой версии руководства не было этого раздела, то логично отнести определение именно к версии (то есть использовать форму включающую). Если раздел был и в старой версии, уместно согласовать определение с существительным руководства (включающего).
