Постановка запятой не требуется. Однако при изменении порядка слов возможно обособление (в этом случае интонационно и логически будет подчеркиваться значение причины): Организация, как не соответствующая требованиям... подлежит исключению...
Конструкция которые указаны в акте осмотра является придаточной частью сложного предложения. Придаточная часть, которая находится внутри главной, обособляется, то есть выделяется запятыми с двух сторон.
Запятая перед и поставлена верно.
Перед словом доктора нужна запятая.
Потому – лексический конкретизатор при союзе и. Союз и вместе с этим конкретизирующим компонентом образует составной союз и потому. См. академическую «Русскую грамматику», § 3110 и 3121.
Такое рассогласование некорректно.
Верно с запятой.
Запятая не ставится.
Логическая связь между частями предложения не вполне ясна, поэтому мы не можем дать рекомендаций по пунктуации.
Если в этом предложении не используется повторяющийся союз либо... либо, для постановки указанной запятой нет оснований.
