Сочетание "Где ты есть?" в принципе возможно, однако достаточно: Где ты?
Вы написали верно: изолятор "Матросская Тишина".
Верен второй вариант.
Запятые не требуются: По истечении шести месяцев с даты изготовления расход средства при необходимости можно увеличить в два раза.
Знаки препинания стоят верно.
Нормам современного русского литературного языка такой вариант образования прилагательных от отчеств не отвечает.
«Русским орфографическим словарем» РАН закреплено написание капучино. Это слово испытывало колебания в написании (что часто случается с заимствованными словами в процессе их освоения языком), поэтому в словарях разных лет можно встретить разные варианты.
Корректно: по согласованию (т. е. "согласовав").
Лучше использовать запятую.
В храмовой архитектуре "главами" как раз и называются купола в форме луковицы. Поэтому сочетание "пятиглавые купола" лексически избыточно, некорректно.