Правильно: два документа. Собирательные числительные (двое, трое, четверо...) употребляются с одушевленными существительными, называющими лиц или животных, а из неодушевленных – только со словами pluralia tantum (употребляющимися лишь в форме множественного числа) и с названиями парных предметов (пятеро ножниц, трое щипцов, двое носков и т. п.).
Обе формы сказуемого возможны.
Лучше: две чашки кофе.
Правильно: два или более органа. Например: Система — это два или более связанных между собой органа со сходными функциями.
Корректно: Так незаметно пролетел час или два. При прямом порядке слов (сказуемое следует за однородными подлежащими) обычно употребляется форма множественного числа сказуемого, при обратном порядке (сказуемое предшествует подлежащим) – форма единственного числа.
Два амбала – косвенный падеж (ср.: два стола). В русском языке есть жаргонное слово амбал – здоровый и физически крепкий, сильный человек.
Запятые не нужны: два миллиарда триста двадцать три миллиона двести тридцать две тысячи триста двадцать три.
Правильно: шестьдесят два ребенка.