Так говорить можно. Четкой границы для смены времени суток нет.
ГОСТ ИСО 8601-2001 «Представление дат и времени дня. Общие требования» указывает, что часы записывают двумя цифрами от 00 до 24. Правильно: 00:29
Запятые не нужны.
Правильно: в количестве 31 коробки и 15 папок.
Из контекста это неясно. Существует распространенное суждение, что предлог по означает 'включительно', а предлог до такого значения не имеет, однако это суждение не подтверждается данными толковых словарей русского языка. См. в «Непростых словах»: до и по.
Указанная запятая не нужна. Начало предложения следует переформулировать, например, так: В ответ на Ваше заявление... или По Вашему заявлению...
Использование слова "копии" во множественном числе в предложении "Направляю в ваш адрес копии приговора суда от 01.01.2020 и решения о прекращении гражданства от 30.10.2020" грамматически корректно. В данном случае "копии" относится к нескольким документам: "приговору суда" и "решению о прекращении гражданства".