Литературная норма требует склонять такие названия в сочетании с родовым словом: над селом Родным, в селе Угловом, под селом Верхнесадовым (если начальная форма — Верхнесадовое). Но в речи официальной, канцелярской географические названия в функции приложения часто остаются несклоняемыми.
Сами по себе эти слова не требуют обособления. Но пунктуация зависит от строя конкретного предложения.
Это означает, что на данном человеке лежит ответственность за содержание книги; он полностью прочитал эту книгу и вмешался в процесс написания там, где это было необходимо.
В каком контексте?
Стилистически фраза построена не очень удачно.
Корректно употребление формы мн.ч.
Смысл предложения не вполне ясен, поэтому сложно дать рекомендации о знаках препинания.
В распоряжении редакции портала множество орфоэпических словарей (и их изданий).
Правильно: под Калязином.
