В обоих случаях возможны оба варианта.
В словарях вариант молиться о чем-либо (например: молиться о здравии) указан как нормативный. Поэтому, если мать молилась, чтобы сын остался жив, предлог о использован верно.
В устойчивом выражении - нА дух (не переносить).
Возможны варианты: на автобусе и в автобусе. Конструкции с предлогом на употребляются для подчеркивания способа передвижения (добирался до работы на автобусе), тогда как сочетания с предлогом в обращают внимание на нахождение внутри данного средства передвижения (в автобусе было душно).
Верно: мнение о происходящем.
В данном случае предлог в лучше повторить.
См. в «Письмовнике».
Предпочтительно: Магазин «Апельсин» на Московском проспекте. Предлог по вносит значение распространения действия по всей территории, например: в домах по Московскому проспекту отключили горячую воду.
Верно: с льготным, со сроками.
1. Корректно без кавычек. 2. Предлог уместен.
